La estructura orgánica de la VRAC, actualizada y formalizada en 2018, está compuesta por seis áreas de gestión y una unidad de apoyo técnico:
- Dirección General de Docencia y la Subdirección de Docencia
- Dirección de Desarrollo Académico
- Dirección de Aseguramiento de la Calidad del Pregrado y Postgrado
- Dirección de Desarrollo Estudiantil
- Dirección de Tecnologías Educativas y Aprendizaje Continuo
- Dirección del Sistema de Bibliotecas
- Unidad de Apoyo Técnico
Esta estructura fue diseñada para fortalecer la efectividad de los procesos formativos, avanzar en la profesionalización de su gestión y dar respuesta oportuna a las demandas internas y externas. Estas últimas han cobrado particular relevancia a partir de la entrada en vigencia de la Ley de Educación Superior N° 21.091 y la Ley de Universidades Estatales N° 21.094.